Pärtel Lippus kaitses doktorikraadi Tartu Ülikoolis 2011. aastal. Lippus on edukas nii teaduspublikatsioonide avaldamisel kui ka rahastuse hankimisel. Ta on järjekindlalt uurinud eesti keele foneetikat ja arendanud uurimissuunda nii Tartu Ülikoolis kui ka rahvusvahelisel tasemel. Lippuse eestvedamisel loodi ja kaasajastati foneetika labor, kus uuritakse eesti ja sugulaskeelte hääldust. Ta on juhendanud ja juhendab ka praegu mitut doktoranti.